Le 24 février 2009, le Haut Conseil de la santé publique (qui avait été mandaté en janvier 2008) a remis son rapport sur l’évaluation du Plan cancer (2003-2007) à la ministre en charge de la Santé. Le rapport du HCSP complète les travaux de la Cour des comptes sur la mise en œuvre du plan dont le rapport a été publié en juillet 2008.

Si les auteurs du rapport du HCSP soulignent des progrès dans le domaine du dépistage de certains cancers, d’une meilleure organisation de la prise en charge et de l’innovation thérapeutique, ils constatent des insuffisances, notamment dans la prise en compte des inégalités sociales et géographiques (accès aux progrès thérapeutiques). Ils remarquent également que certaines données ne sont pas encore disponibles (expositions environnementales aux cancérigènes…) et que certaines mesures ont tardé à être mises en route et de ce fait, ne produiront leurs effets qu’au-delà de la période du plan (dispositifs d’agrément des établissements de soins…). Étant donné le manque de recul et les délais de mise à disposition des données épidémiologiques, les auteurs du rapport observent que les effets et les impacts du plan sur la population sont difficiles à évaluer à ce stade et préconisent d’effectuer des mesures complémentaires à échéance plus lointaine.